RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 GCP02774 474 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ICA1Q05084 483 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 LRRC53A6NM62 1247 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 IRF6O14896 467 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ORC4O43929 436 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PHKG2P15735 406 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ADCY2Q08462 1091 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CHADLQ6NUI6 762 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 DISC1Q9NRI5 854 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CCT8L1PA6NM43 557 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PALMO75781 387 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 METTL24Q5JXM2 366 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 RRAGAQ7L523 313 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 SAAL1Q96ER3 474 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ZNF570Q96NI8 536 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 MDM1Q8TC05 714 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 ISCUQ9H1K1 167 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 TMTC2Q8N394 836 aa23.39■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa23.39■■□□□ 1.34
ODC1-201ENST00000234111 PP2D1A8MPX8 630 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 RHOBTB3O94955 611 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 FUT2Q10981 343 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 AGAP11Q8TF27 550 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 P2RX5Q93086 422 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CHD4Q14839 1912 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 ADAMTS3O15072 1205 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 AP1G2O75843 785 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 LRRC45Q96CN5 670 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CHMP6Q96FZ7 201 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 SLC12A4Q9UP95 1085 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 MYBP10242 640 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 FLT3P36888 993 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 TNNC1P63316 161 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 NDST4Q9H3R1 872 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 PANK4Q9NVE7 773 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 TNKSO95271 1327 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD33BA6NCL7 494 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CCNE1P24864 410 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 RCAN1P53805 252 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 EHHADHQ08426 723 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 AGBL2Q5U5Z8 902 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 PHKA1P46020 1223 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 ETAA1Q9NY74 926 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 DIAPH2O60879 1101 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 USP38Q8NB14 1042 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 FBXO3Q9UK99 471 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 RIPK1Q13546 671 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 KRT71Q3SY84 523 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-201ENST00000234111 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms