RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 CPVLQ9H3G5 476 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 IRAK1P51617 712 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GBP6Q6ZN66 633 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 RRAGAQ7L523 313 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PDXDC1Q6P996 788 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 CAVIN3Q969G5 261 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 DRC1Q96MC2 740 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 STIM2Q9P246 746 aa24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 EHHADHQ08426 723 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 ALS2CLQ60I27 953 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SNED1Q8TER0 1413 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 OPA1O60313 960 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TXKP42681 527 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO41Q8TF61 875 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TLR10Q9BXR5 811 aa24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PAFAH1B1P43034 410 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC181Q5TID7 509 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 BARGINQ6ZT62 677 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TSKSQ9UJT2 592 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 TM4SF1P30408 202 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMD2Q13200 908 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 PPM1EQ8WY54 764 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 RIC8AQ9NPQ8 531 aa24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1-201ENST00000218364 NNTQ13423 1086 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 HGSNATQ68CP4 663 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF14Q9UBS8 474 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 PDIA5Q14554 519 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CALCRLQ16602 461 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 RAD54LQ92698 747 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NOX5Q96PH1 765 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 HINFPQ9BQA5 517 aa24.51■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A5Q01650 507 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 PIGSQ96S52 555 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 EYA3Q99504 573 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM107BQ9H098 131 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 LDHCP07864 332 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NOVP48745 357 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK8P49336 464 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 DYMQ7RTS9 669 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 PROM2Q8N271 834 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR8Q96EF0 704 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.5■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CXCR5P32302 372 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNMA1Q12791 1236 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM260Q9NX78 707 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNQ2O43526 872 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NCK2O43639 380 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CLSTN1O94985 981 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CPP00450 1065 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIK5Q16478 980 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 SETDB2Q96T68 719 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIN2DO15399 1336 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 CERS3Q8IU89 383 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 TSG101Q99816 390 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 EHD2Q9NZN4 543 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 NARFQ9UHQ1 456 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 EDIL3O43854 480 aa24.48■■□□□ 1.51
HTATSF1-201ENST00000218364 SKOR1P84550 965 aa24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms