RNA–Protein interactions for RNA: YMR054W

STV1, Transcript of Subunit a of the vacuolar-ATPase V0 domain, yeast

Gene STV1, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STV1	YMR054W	YJL107C	P42947	387 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GTO1	P48239	356 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	COQ6	P53318	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YAT1	P80235	687 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CRN1	Q06440	651 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	VAC14	Q06708	880 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GAL3	P13045	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	UGA1	P17649	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MRPL7	P36519	292 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PCA1	P38360	1216 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YIP5	P53108	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PNG1	Q02890	363 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	GAS5	Q08193	484 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	AHC1	Q12433	566 aa		4.17	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	BCS1	P32839	456 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	AGP2	P38090	596 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	TAE1	P38340	232 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SIP3	P38717	1229 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	NMD5	P46970	1048 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	OCA2	P53949	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SRL4	Q03085	281 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	AEP3	Q12089	606 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RSR1	P13856	272 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YKR015C	P36111	568 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MSY1	P48527	492 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MRK1	P50873	501 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	PRM1	P53835	661 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	DSL1	P53847	754 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YNL092W	P53934	400 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SLG1	P54867	378 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RSN1	Q03516	953 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	BCP1	Q06338	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	FRE5	Q08908	694 aa		4.16	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	AAC1	P04710	309 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	ARG81	P05085	880 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	CDC20	P26309	610 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	YBR144C	P34215	104 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	STV1	P37296	890 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SDH8	P38345	138 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	STN1	P38960	494 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	EKI1	Q03764	534 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	MDM30	Q05930	598 aa		4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
STV1	YMR054W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
STV1	YMR054W	SEC12	P11655	471 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	APA2	P22108	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	TRM2	P33753	639 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PIH1	P38768	344 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SBE22	P38814	852 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YER085C	P40058	173 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	OPT1	P40897	799 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	BAP3	P41815	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	AIM22	P47051	409 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	YPR089W	O13585	888 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	AI1	P03875	834 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	HIR2	P32480	875 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SUA5	P32579	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	AIM26	P32858	118 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
STV1	YMR054W	NUP133	P36161	1157 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	OTU1	P43558	301 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	NPA3	P47122	385 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	MSE1	P48525	536 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	PGA2	P53903	129 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	DCS1	Q06151	350 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	AFT2	Q08957	416 aa		4.14	□□□□□ -1.75
STV1	YMR054W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75

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