RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	RIP1	P08067	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GAC1	P28006	793 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TRM2	P33753	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MMS4	P38257	691 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SPT20	P50875	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MDM30	Q05930	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
SEO1	YAL067C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PUT2	P07275	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	CHO1	P08456	276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	KRE2	P27809	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MBB1	P39534	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SMA1	Q02651	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	WAR1	Q03631	944 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ARV1	Q06541	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PDE2	P06776	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	COR1	P07256	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PMR1	P13586	950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SPE2	P21182	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PET18	P25362	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	DMC1	P25453	334 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	NTG1	P31378	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	IAH1	P41734	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ATG4	P53867	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	EKI1	Q03764	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	POS5	Q06892	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SEC63	P14906	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ALG1	P16661	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	CNA1	P23287	553 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	BEM1	P29366	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SIN4	P32259	974 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ARP1	P38696	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	AIM20	P40451	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RHO2	P06781	192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	WHI2	P12611	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RAD51	P25454	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PTC6	P25646	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	HMX1	P32339	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TPO5	P36029	618 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GLG1	P36143	616 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ANS1	P38832	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PMT6	P42934	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TMA10	Q06177	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	IPK1	Q06667	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	UNG1	P12887	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MRP4	P32902	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YKL070W	P36087	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	DBP8	P38719	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	PIH1	P38768	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GPI16	P38875	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ROG1	P53118	685 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YPR003C	P53394	754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	RSM23	Q01163	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SRN2	Q99176	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	GAL3	P13045	520 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	SEC62	P21825	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	ELM1	P32801	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	VHC1	P38329	1120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	BZZ1	P38822	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	MNL1	P38888	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	STN1	P38960	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YER130C	P39959	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	YGL242C	P53066	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SEO1	YAL067C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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