RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ6P48051 423 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC4DQ8WXI8 215 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PNMA2Q9UL42 364 aa32.21■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOR1O75376 2440 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 BDP1A6H8Y1 2624 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF15O94989 841 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NOVP48745 357 aa32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6P62753 249 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
CAPNS1-217ENST00000629983 LCTP09848 1927 aa32.2■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NJR5 290 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 B4DLN1 442 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TLL1O43897 1013 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC155Q8N6L0 562 aa32.19■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-CQ95604 372 aa32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 BAIAP3O94812 1187 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GRB10Q13322 594 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGISQ16647 500 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DNERQ8NFT8 737 aa32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PDHBP11177 359 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EDNRBP24530 442 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 USH1GQ495M9 461 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBED2Q9BTP6 218 aa32.16■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN5AQ14524 2016 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF543Q08ER8 600 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHX3Q9H6B9 360 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR19Q8NEZ3 1342 aa32.14■■■□□ 2.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ARIH2O95376 493 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FGRP09769 529 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ALX1Q15699 326 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRED2Q7Z698 418 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CAGE1Q8TC20 777 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 AFAP1L1Q8TED9 768 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HELLSQ9NRZ9 838 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa32.13■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR5P61964 334 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST3Q7LGC8 479 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 AFG1LQ8WV93 481 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 EVI5LQ96CN4 794 aa32.12■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FGAP02671 866 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HAND2P61296 217 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GDPD5Q8WTR4 605 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LRFN3Q9BTN0 628 aa32.11■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LCHNA4D1U4 455 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT14Q6ZU15 432 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC8DQ7L1W4 858 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MTUS1Q9ULD2 1270 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 XIRP2A4UGR9 3374 aa32.1■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GH1P01241 217 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP3P08254 477 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8HP0CJ92 632 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SELPP16109 830 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM31Q5JXX7 168 aa32.09■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TANC1Q9C0D5 1861 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LY6KQ17RY6 165 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM227BQ96M60 508 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CRBNQ96SW2 442 aa32.08■■■□□ 2.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LPXNO60711 386 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB103AP81534 67 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CNKSR3Q6P9H4 555 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC14Q96N46 770 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 UBA5Q9GZZ9 404 aa32.07■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0D9SFI3 127 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CASTP20810 708 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC62Q6P9F0 684 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD6Q6ZSS7 791 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CPVLQ9H3G5 476 aa32.06■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SNHG28P0DPA3 235 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP1Q07960 439 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD45Q5TZF3 282 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SESTD1Q86VW0 696 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf31Q8N865 590 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS22Q8NE09 1264 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG1Q9BT22 464 aa32.05■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 REV3LO60673 3130 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PARNO95453 639 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM117BQ6P1L5 589 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT2BQ92831 832 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TAAR1Q96RJ0 339 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CTAGE1Q96RT6 745 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa32.04■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SALL3Q9BXA9 1300 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 STXBP2Q15833 593 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKDQ16760 1214 aa32.03■■■□□ 2.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
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