RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612791.4

MED25-209, Transcript of mediator complex subunit 25, human

TSL 5 BASIC

Gene MED25, Length 881 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED25-209	ENST00000612791	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	BFSP2	Q13515	415 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	MYH8	P13535	1937 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	GOLIM4	O00461	696 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	NBN	O60934	754 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CYP2D6	P10635	497 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	PDE6A	P16499	860 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	NUCB1	Q02818	461 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	RBL2	Q08999	1139 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CLUL1	Q15846	466 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	ASB14	A6NK59	587 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	TBX10	O75333	385 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	HYAL1	Q12794	435 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	GPM6B	Q13491	265 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MED25-209	ENST00000612791	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	EYA4	O95677	639 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	EFCAB14	O75071	495 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	SELP	P16109	830 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	LCT	P09848	1927 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	USP17L21	D6R901	530 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	MYL3	P08590	195 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	OAZ1	P54368	228 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	ADAM15	Q13444	863 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.31	□□□□□ -0.28
MED25-209	ENST00000612791	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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