RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC1A4P43007 532 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP3K9P80192 1104 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM14Q14142 442 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DACT2Q5SW24 774 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNK18Q7Z418 384 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EPC1Q9H2F5 836 aa24.32■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TADA3O75528 432 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GDF11O95390 407 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLK7P49862 253 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEPT2Q15019 361 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRT79Q5XKE5 535 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EHD4Q9H223 541 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM51Q9NW97 253 aa24.31■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IDEP14735 1019 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FECHP22830 423 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC17Q96LX7 622 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BICDL2A1A5D9 508 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H0YIN7 160 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ECM1Q16610 540 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AOC3Q16853 763 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLFN13Q68D06 897 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HAS1Q92839 578 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAB34Q9BZG1 259 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.3■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF5CO60282 957 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.29■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAD54LQ92698 747 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTMR8Q96EF0 704 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STK17AQ9UEE5 414 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SEMA3FQ13275 785 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.28■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDIA5Q14554 519 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1W2PQC6 194 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EFCAB8A8MWE9 144 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERCC3P19447 782 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNM2P50570 870 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ICA1Q05084 483 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX12PQ92771 950 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.27■■□□□ 1.48
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC41Q15345 812 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UNC13DQ70J99 1090 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH8P13535 1937 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLCN6P51797 869 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX35Q5T0J7 233 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC35F6Q8N357 371 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.26■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IDI2Q9BXS1 227 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM10Q9UDY6 481 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TFR2Q9UP52 801 aa24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RASSF10A6NK89 507 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGAP25P42331 645 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 JAG1P78504 1218 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MIIPQ5JXC2 388 aa24.24■■□□□ 1.47
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms