RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP3A4P08684 503 aa29.51■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 COL20A1Q9P218 1284 aa29.51■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CIITAP33076 1130 aa29.5■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CALCRLQ16602 461 aa29.5■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 LRSAM1Q6UWE0 723 aa29.5■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 GAS2L3Q86XJ1 694 aa29.5■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.5■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 MB21D1Q8N884 522 aa29.49■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 TIGD1Q96MW7 591 aa29.49■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 STAT3P40763 770 aa29.49■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD7Q9P203 1132 aa29.49■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 HERVK_113P62684 666 aa29.48■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 TKFCQ3LXA3 575 aa29.48■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 RPTORQ8N122 1335 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM86B1E9PN63 330 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 HAS1Q92839 578 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 LENG9Q96B70 501 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A087X0B3 334 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CTAGE5O15320 804 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 Q4G0T1 1027 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 EHMT1Q9H9B1 1298 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNMB3Q9NPA1 279 aa29.47■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 GTF2A2P52657 109 aa29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 LONRF3Q496Y0 759 aa29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 SPRYD7Q5W111 196 aa29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CKAP2LQ8IYA6 745 aa29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 IGSF22Q8N9C0 903 aa29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 FUCA2Q9BTY2 467 aa29.46■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 FRMPD4Q14CM0 1322 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 PASKQ96RG2 1323 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 FSD2A1L4K1 749 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 PEX10O60683 326 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CETPP11597 493 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 PLS1Q14651 629 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 AK8Q96MA6 479 aa29.45■■■□□ 2.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CNMDO75829 334 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TXKP42681 527 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 SDF4Q9BRK5 362 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 ACAD9Q9H845 621 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC25AP30304 524 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 HUNKP57058 714 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 UBXN2AP68543 259 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 NSMFQ6X4W1 530 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PDILTQ8N807 584 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 ETNPPLQ8TBG4 499 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PANK2Q9BZ23 570 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 MAF1Q9H063 256 aa29.44■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PP2D1A8MPX8 630 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 OSBPP22059 807 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TECP42680 631 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PRR16Q569H4 304 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 BRI3BPQ8WY22 251 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.43■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF3CO14782 793 aa29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CCL15Q16663 113 aa29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CHST13Q8NET6 341 aa29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.42■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TAAR1Q96RJ0 339 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TBX3O15119 743 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 E2F4Q16254 413 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 GJA10Q969M2 543 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 SERTAD1Q9UHV2 236 aa29.41■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 BTBD19C9JJ37 291 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PDIA5Q14554 519 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM266Q2M3C6 531 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CNNM3Q8NE01 707 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 IL31RAQ8NI17 732 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.4■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF76P36508 570 aa29.39■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 PNMA3Q9UL41 463 aa29.39■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 LCTP09848 1927 aa29.39■■■□□ 2.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TXLNAP40222 546 aa29.39■■■□□ 2.29
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