RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 SCFD2Q8WU76 684 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 RMDN3Q96TC7 470 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 TBX21Q9UL17 535 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 GRIN2DO15399 1336 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 SZT2Q5T011 3432 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 TLR3O15455 904 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 CYTH3O43739 400 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 ARIH2O95376 493 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 FPGSQ05932 587 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 CASC1Q6TDU7 716 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 SEPT14Q6ZU15 432 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 LY9Q9HBG7 655 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 TIMP1P01033 207 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 NECTIN1Q15223 517 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 SLC43A3Q8NBI5 491 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 LAMA3Q16787 3333 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-203ENST00000587752 CD4P01730 458 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MCM5P33992 734 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CPT1AP50416 773 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 HSD17B4P51659 736 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TTLL4Q14679 1199 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 STXBP2Q15833 593 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 LY6KQ17RY6 165 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TRPV6Q9H1D0 765 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 PXMP2Q9NR77 195 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 POLR3EQ9NVU0 708 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP17.44■□□□□ 0.385e-7■■□□□ 12.6
CTIF-203ENST00000587752 NR3C2P08235 984 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 RXRAP19793 462 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CYP2C18P33260 490 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CHMP4BP1P59074 171 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 PURAQ00577 322 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 GPR153Q6NV75 609 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 IWS1Q96ST2 819 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MAF1Q9H063 256 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CCDC69A6NI79 296 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 B4GALT4O60513 344 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 DDAH1O94760 285 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CSF2RAP15509 400 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MFSD5Q6N075 450 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CCDC62Q6P9F0 684 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TMEM87BQ96K49 555 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 FAM161BQ96MY7 647 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.43■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CDC45O75419 566 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 PLEKHA8P1O95397 391 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 POLR2MP0CAP2 368 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 ACRP10323 421 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 IL31RAQ8NI17 732 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 AFG1LQ8WV93 481 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.387e-7■□□□□ 8.5
CTIF-203ENST00000587752 PDCD2LQ9BRP1 358 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 HIPK3Q9H422 1215 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MTMR10Q9NXD2 777 aa17.42■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 A6NJR5 290 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 SORBS3O60504 671 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 GH1P01241 217 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 KIF5BP33176 963 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CCL23P55773 120 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 GHRHRQ02643 423 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TRAF1Q13077 416 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.381e-8■■□□□ 13.1
CTIF-203ENST00000587752 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 RNF20Q5VTR2 975 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TMEM199Q8N511 208 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TCEANC2Q96MN5 208 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MTA3Q9BTC8 594 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 MRVI1Q9Y6F6 885 aa17.41■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 CYP2C9P11712 490 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 ARHGAP1Q07960 439 aa17.4■□□□□ 0.38
CTIF-203ENST00000587752 PGM5Q15124 567 aa17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms