RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ANO3Q9BYT9 981 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 DOK7Q18PE1 504 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ERBB4Q15303 1308 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MGEA5O60502 916 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 EPHB4P54760 987 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC12Q96J65 1359 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ODR4Q5SWX8 454 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 HACE1Q8IYU2 909 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP61Q8NHU2 1237 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MORC4Q8TE76 937 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 NR2F2P24468 414 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 CUL4AQ13619 759 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC41Q15345 812 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SOWAHDA6NJG2 315 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 AOC3Q16853 763 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 IFT88Q13099 833 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 AK8Q96MA6 479 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 IFNAR2P48551 515 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 KIF11P52732 1056 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MMP1P03956 469 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PTK2Q05397 1052 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ITKQ08881 620 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 NME8Q8N427 588 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 RETREG2Q8NC44 543 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SUN1O94901 812 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SAT1P21673 171 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 IL9RQ01113 521 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 E2F4Q16254 413 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MIS12Q9H081 205 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 HESX1Q9UBX0 185 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 H7C0C1 242 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5OP48047 213 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MOCS3O95396 460 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 DBN1Q16643 649 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 RNF8O76064 485 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 GARSP41250 739 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 RFX6Q8HWS3 928 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 WDR70Q9NW82 654 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SYNMO15061 1565 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SGK1O00141 431 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MAN2A1Q16706 1144 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 NT5C1BQ96P26 610 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 CCPG1Q9ULG6 757 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ADD2P35612 726 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1FO00160 1098 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 TNFAIP1Q13829 316 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 PGBD1Q96JS3 809 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 SLFN14P0C7P3 912 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP4P98171 946 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 LMNB2Q03252 620 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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