RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STX17P56962 302 aa27.01■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNAP25P60880 206 aa27.01■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXCL9Q07325 125 aa27.01■■□□□ 1.91
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP17L22D6RA61 530 aa26.98■■□□□ 1.91
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARD6BQ9BYG5 372 aa26.95■■□□□ 1.9
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLGA1Q92805 767 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMNQ9BXJ7 453 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.94■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WNT10BO00744 389 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASP14P31944 242 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.93■■□□□ 1.9
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP2C19P33261 490 aa26.93■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
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