RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.04■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 STK17AQ9UEE5 414 aa23.04■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.04■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 KLRC4O43908 158 aa23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.03■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 AMPD3Q01432 767 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 Q4G0T1 1027 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 INPP5BP32019 993 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 CIITAP33076 1130 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 KMT5BQ4FZB7 885 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.02■■□□□ 1.28
CTU2-210ENST00000567949 ABCB11O95342 1321 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CYP3A4P08684 503 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 TRIM9Q9C026 710 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.01■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 TBX3O15119 743 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 RHOBTB3O94955 611 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 TMEM119Q4V9L6 283 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ILDR2Q71H61 639 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GJA10Q969M2 543 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 NUDT12Q9BQG2 462 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 POLR2MP0CAP2 368 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 STX17P56962 302 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GSDMDP57764 484 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 LRMPQ12912 555 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SV2BQ7L1I2 683 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 LDHDQ86WU2 507 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SCYL3Q8IZE3 742 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SLF1Q9BQI6 1058 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GDAQ9Y2T3 454 aa23■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 DOCK1Q14185 1865 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CFBP00751 764 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PRR16Q569H4 304 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 TMC6Q7Z403 805 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 LENG9Q96B70 501 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.99■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SBF1O95248 1867 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 FAM86B1E9PN63 330 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 SLC26A4O43511 780 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 EPS15P42566 896 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PAK1Q13153 545 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 HYIQ5T013 277 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 TBC1D5Q92609 795 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 WDR18Q9BV38 432 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GGA3Q9NZ52 723 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ICAM1P05362 532 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PRCPP42785 496 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 RAD54LQ92698 747 aa22.98■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ZNF536O15090 1300 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 USP14P54578 494 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ASIC1P78348 528 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 MTMR2Q13614 643 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ADSSL1Q8N142 457 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 NELFBQ8WX92 580 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 FAM20AQ96MK3 541 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.97■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 MCM6Q14566 821 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 ARID5BQ14865 1188 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 WRNIP1Q96S55 665 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.96■■□□□ 1.27
CTU2-210ENST00000567949 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms