RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567909.1

GINS3-209, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene GINS3, Length 210 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-209ENST00000567909 PXMP2Q9NR77 195 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-209ENST00000567909 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GINS3-209ENST00000567909 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-209ENST00000567909 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-209ENST00000567909 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GINS3-209ENST00000567909 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 STXBP3O00186 592 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PFKFB2O60825 505 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 LARGE1O95461 756 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 UBE2SQ16763 222 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ME3Q16798 604 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 NECAB1Q8N987 351 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 MORC4Q8TE76 937 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 VTA1Q9NP79 307 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 BARHL2Q9NY43 387 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 MEIS2O14770 477 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 DTNBO60941 627 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 EDNRBP24530 442 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 RGS19P49795 217 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 RABEP1Q15276 862 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PKN1Q16512 942 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 IWS1Q96ST2 819 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SMCO2A6NFE2 343 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PIK3CDO00329 1044 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ADCY6O43306 1168 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 CDKL5O76039 1030 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PGK1P00558 417 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 NR3C2P08235 984 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ADCY7P51828 1080 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TNFAIP2Q03169 654 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 STXBP2Q15833 593 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 IL31RAQ8NI17 732 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 CAPN2P17655 700 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 CCND2P30279 289 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PGM5Q15124 567 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 GTF3C6Q969F1 213 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 KBTBD13C9JR72 458 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 ST18O60284 1047 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 DEXIO95424 95 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SMPD1P17405 629 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PTGS1P23219 599 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 LRRC41Q15345 812 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 CTDNEP1O95476 244 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 RNF180Q86T96 592 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 TLK2Q86UE8 772 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SCFD2Q8WU76 684 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 PGBD1Q96JS3 809 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 AIFM3Q96NN9 605 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 SPC25Q9HBM1 224 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-209ENST00000567909 C6orf50Q9HD87 102 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 725.8 ms