RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562957.1

RHOT2-208, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 2

Gene RHOT2, Length 397 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-208	ENST00000562957	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	GPR37L1	O60883	481 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	CXCL10	P02778	98 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	SESTD1	Q86VW0	696 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	TBC1D5	Q92609	795 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	FAM122A	Q96E09	287 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	NAPB	Q9H115	298 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	COG5	Q9UP83	839 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	NBN	O60934	754 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	MYL3	P08590	195 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	PDHB	P11177	359 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	CPT1A	P50416	773 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	HIC1	Q14526	733 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	MBTPS1	Q14703	1052 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	WNT8B	Q93098	351 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RHOT2-208	ENST00000562957	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	FGA	P02671	866 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	DEFB103A	P81534	67 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ARHGAP1	Q07960	439 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	HLA-C	Q95604	372 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	COL20A1	Q9P218	1284 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	SI	P14410	1827 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	HAS3	O00219	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	KPNA6	O60684	536 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ERVK-21	P61565	698 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	RGS20	O76081	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	GJB5	O95377	273 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ACTN1	P12814	892 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	CALML3	P27482	149 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	AFG1L	Q8WV93	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	OPLAH	O14841	1288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	MMP3	P08254	477 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	CKB	P12277	381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	BFSP2	Q13515	415 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	PTGIS	Q16647	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RHOT2-208	ENST00000562957	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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