RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFBP00751 764 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLR2MP0CAP2 368 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATG4CQ96DT6 458 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 RLFQ13129 1914 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYPNQ86TC9 1320 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 AP5Z1O43299 807 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SREBF1P36956 1147 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAMQ92783 540 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMARCE1Q969G3 411 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLIN2Q99541 437 aa20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 UNCXA6NJT0 531 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CXCL11O14625 94 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 IRF6O14896 467 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP3A7P24462 503 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASP1P29466 404 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 OAZ1P54368 228 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP4P98171 946 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 GHRHRQ02643 423 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPXCR1Q8N123 301 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 REPS2Q8NFH8 660 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 OTUD5Q96G74 571 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MBOAT7Q96N66 472 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 UIMC1Q96RL1 719 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRFP10586 1907 aa20.12■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAF5O00463 557 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAT6P42226 847 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPIL2Q13356 520 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CABP7Q86V35 215 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 GJA10Q969M2 543 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNK4Q96J92 1243 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 AK8Q96MA6 479 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 DISC1Q9NRI5 854 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 BECN2A8MW95 431 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MARCH6O60337 910 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADCY5O95622 1261 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSD17B4P51659 736 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAS1Q92839 578 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.11■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP3A4P08684 503 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.1■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP2A1O14983 1001 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SMC2O95347 1197 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALAS1P13196 640 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CIITAP33076 1130 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 TREML2Q5T2D2 321 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFIBO00712 420 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 BMP6P22004 513 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 OPTNQ96CV9 577 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTRQ99707 1265 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEMA6NI47 508 aa20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FKBP1BP68106 108 aa20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPYDQ12882 1025 aa20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q4G0T1 1027 aa20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR16Q569H4 304 aa20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA20Q8TB22 786 aa20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
USP3-AS1-208ENST00000560962 EHMT1Q9H9B1 1298 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms