RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	MEIS2	O14770	477 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	SGPL1	O95470	568 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHA2	P01877	340 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	BECN1	Q14457	450 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	CALM1	P0DP23	149 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	CALM2	P0DP24	149 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	CALM3	P0DP25	149 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	NAPA	P54920	295 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	PRMT2	P55345	433 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	LY6K	Q17RY6	165 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO40	Q9UH90	709 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM227B-208	ENST00000559573	ABCB11	O95342	1321 aa		11.65	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	STXBP3	O00186	592 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	GJB1	P08034	283 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	GJA8	P48165	433 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	GJA10	Q969M2	543 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	CPLX1	O14810	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	RGS20	O76081	388 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	FDX1	P10109	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SMPD1	P17405	629 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	ANAPC15	P60006	121 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SP4	Q02446	784 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PFAS	O15067	1338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SMCO2	A6NFE2	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	EVC	P57679	992 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SP2	Q02086	613 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	NR3C2	P08235	984 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SCG2	P13521	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	GNAQ	P50148	359 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	HSD17B4	P51659	736 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PDE4D	Q08499	809 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PGM5	Q15124	567 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	REV3L	O60673	3130 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SEPT4	O43236	478 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	NT5C2	P49902	561 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PFKFB2	O60825	505 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SYN1	P17600	705 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	MRE11	P49959	708 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PSMC6	P62333	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	TNFAIP2	Q03169	654 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM227B-208	ENST00000559573	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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