RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SEPT4O43236 478 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEXIO95424 95 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LARGE1O95461 756 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EDNRBP24530 442 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GJA8P48165 433 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEFB118Q96PH6 123 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IWS1Q96ST2 819 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RMDN3Q96TC7 470 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KATNBL1Q9H079 304 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VTA1Q9NP79 307 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STK36Q9NRP7 1315 aa14.83□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ESYT2A0FGR8 921 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POTEFA5A3E0 1075 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MEIS2O14770 477 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SGPL1O95470 568 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AKR1A1P14550 325 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CNGA1P29973 690 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDE4DQ08499 809 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ACVR2BQ13705 512 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PXMP2Q9NR77 195 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.82□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PPFIA3O75145 1194 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADCY7P51828 1080 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LHX8Q68G74 356 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NECAB1Q8N987 351 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHISA4Q96DD7 197 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.81□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMCO2A6NFE2 343 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CTDNEP1O95476 244 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MCM2P49736 904 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.8□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NR3C2P08235 984 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RARBP10826 455 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GNA11P29992 359 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ST3GAL1Q11201 340 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PGM5Q15124 567 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STXBP2Q15833 593 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WASF1Q92558 559 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C6orf50Q9HD87 102 aa14.79□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCND2P30279 289 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AP3B2Q13367 1082 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE2SQ16763 222 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BICD2Q8TD16 824 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNF39Q9H2S5 420 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.78□□□□□ -0.04
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STAM2O75886 525 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TNFAIP2Q03169 654 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MCTP2Q6DN12 878 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.77□□□□□ -0.05
SRP54-AS1-202ENST00000555015 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms