RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CYTH3O43739 400 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 AKR1A1P14550 325 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SLC27A2O14975 620 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SGSM2O43147 1006 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 STRNO43815 780 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ZNF76P36508 570 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ZNF365Q70YC5 407 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 MYH1P12882 1939 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 CYBAP13498 195 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ANTXR2P58335 489 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PPP2R5BQ15173 497 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 Q6ZUG5 572 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 GLG1Q92896 1179 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 LIG1P18858 919 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 RGS19P49795 217 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.029e-7■■□□□ 12.9
CS-212ENST00000548567 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GGPS1O95749 300 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SLC25A27O95847 323 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ITGA7Q13683 1181 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MAEAQ7L5Y9 396 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 TET1Q8NFU7 2136 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 TMEM150BA6NC51 233 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 UNCXA6NJT0 531 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NR3C2P08235 984 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NAPAP54920 295 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 IRF5Q13568 498 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CERS3Q8IU89 383 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 C12orf42Q96LP6 360 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 HIPK3Q9H422 1215 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SETD4Q9NVD3 440 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 BACH1O14867 736 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CALM1P0DP23 149 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CALM2P0DP24 149 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CALM3P0DP25 149 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CLUL1Q15846 466 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SPATA33Q96N06 139 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 NEK1Q96PY6 1258 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 BACH2Q9BYV9 841 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CPLX1O14810 134 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MARCH6O60337 910 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ATP9AO75110 1047 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SP2Q02086 613 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 MB21D1Q8N884 522 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 REPS2Q8NFH8 660 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 APOL5Q9BWW9 433 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 KRT23Q9C075 422 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 GNRH1P01148 92 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 CDC27P30260 824 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 TFF2Q03403 129 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-212ENST00000548567 FGD4Q96M96 766 aa8.69□□□□□ -1.02
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