RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544805.1

RNF10-222, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 2

Gene RNF10, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PSME4	Q14997	1843 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	IL4R	P24394	825 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CACNB3	P54284	484 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FUT2	Q10981	343 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	GRIK5	Q16478	980 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	AACS	Q86V21	672 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	BICD1	Q96G01	975 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NACA2	Q9H009	215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SPTLC1	O15269	473 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SGTA	O43765	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	IDE	P14735	1019 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NDUFV2	P19404	249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PRDX5	P30044	214 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CTH	P32929	405 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TCP10	Q12799	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	POSTN	Q15063	836 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CNGA3	Q16281	694 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	USP33	Q8TEY7	942 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TSC1	Q92574	1164 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FOXN1	O15353	648 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF24	P17028	368 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	USP6NL	Q92738	828 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM87B	Q96K49	555 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RNF10-222	ENST00000544805	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8

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