RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPA1P15085 419 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMPD1P17405 629 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RUFY3Q7L099 469 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCFD2Q8WU76 684 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYADML2A6NDP7 307 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CTAGE5O15320 804 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLR2MP0CAP2 368 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACLYP53396 1101 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EVCP57679 992 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF16Q5VV41 709 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRF1Q92994 677 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FRMPD4Q14CM0 1322 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CEP290O15078 2479 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 hCG_1984214I3L0E3 225 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIK3CDO00329 1044 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANAPC15P60006 121 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FUT2Q10981 343 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STXBP2Q15833 593 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNA10Q16322 511 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIBF1Q8WXW3 757 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PDCD2LQ9BRP1 358 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.67■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASGR1P07306 291 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RTP1P59025 263 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APOBRQ0VD83 1088 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNASQ5JWF2 1037 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FERMT2Q96AC1 680 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GLT1D1Q96MS3 346 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ELP1O95163 1332 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NR3C2P08235 984 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDC27P30260 824 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TTLL4Q14679 1199 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PGM5Q15124 567 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP1R18Q6NYC8 613 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC82Q8N4S0 544 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CUL5Q93034 780 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL17RAQ96F46 866 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STARD7Q9NQZ5 370 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.64■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MEIS2O14770 477 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZEB2O60315 1214 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CABYRO75952 493 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM63BQ5T3F8 832 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STAM2O75886 525 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPT1AP50416 773 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BEX3Q00994 111 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM60Q495X7 471 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VSIG10LQ86VR7 867 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PRO3102Q9H379 93 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARIH2O95376 493 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CCND2P30279 289 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOX2Q96NM4 488 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms