RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	CD4	P01730	458 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTLL4	Q14679	1199 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	SKAP1	Q86WV1	359 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	COPS5	Q92905	334 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANTXR2	P58335	489 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	STXBP2	Q15833	593 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM199	Q8N511	208 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	PIGS	Q96S52	555 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	IWS1	Q96ST2	819 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	TROAP	Q12815	778 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	28.97	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM161B	Q96MY7	647 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	ARIH2	O95376	493 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRAF1	Q13077	416 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PTPRJ-206	ENST00000534219	OPLAH	O14841	1288 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CSF2RA	P15509	400 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CYP2C18	P33260	490 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	HSD17B4	P51659	736 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	HIPK3	Q9H422	1215 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	PXMP2	Q9NR77	195 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC27A2	O14975	620 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	PRC1	O43663	620 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	B4GALT4	O60513	344 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	LY6K	Q17RY6	165 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219		A6NJR5	290 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CYTH3	O43739	400 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	KPNA6	O60684	536 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	NR3C2	P08235	984 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MCM5	P33992	734 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	LY9	Q9HBG7	655 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYL10	Q9BUA6	226 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	GH1	P01241	217 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	ACR	P10323	421 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CHMP4BP1	P59074	171 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCDC69	A6NI79	296 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	POLR2M	P0CAP2	368 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	KIF5B	P33176	963 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCL23	P55773	120 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	GHRHR	Q02643	423 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	NECTIN1	Q15223	517 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMTC2	Q8N394	836 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	AFG1L	Q8WV93	481 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTA3	Q9BTC8	594 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDAH1	O94760	285 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM240	Q5SV17	173 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PTPRJ-206	ENST00000534219	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF365	Q70YC5	407 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	IL23A	Q9NPF7	189 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPRJ-206	ENST00000534219	COL6A3	P12111	3177 aa		28.87	■■■□□ 2.21

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