RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IL1R1	P14778	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EXOC5	O00471	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLC37A4	O43826	429 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	STAT6	P42226	847 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	INF2	Q27J81	1249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEA9	P43362	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CERK	Q8TCT0	537 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KAT2B	Q92831	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MYH11	P35749	1972 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KCNQ2	O43526	872 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ERLIN1	O75477	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R2	P41236	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IRAK1	P51617	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EVA1C	P58658	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NLRP5	P59047	1200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KRT83	P78385	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TFAP4	Q01664	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PDIA5	Q14554	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MCM6	Q14566	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	POTED	Q86YR6	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IVL	P07476	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KIF11	P52732	1056 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	JAM2	P57087	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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