RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 COL6A1P12109 1028 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 STXBP2Q15833 593 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS4O75173 837 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ALPK3Q96L96 1907 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ADCY6O43306 1168 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 NR3C2P08235 984 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 GJA9P57773 515 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD1Q15327 319 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 SCFD2Q8WU76 684 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 Q9Y3F1 56 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PIK3CDO00329 1044 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 SMPD1P17405 629 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 NAPAP54920 295 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 TLK2Q86UE8 772 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-222ENST00000532751 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 TTLL4Q14679 1199 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 PGM5Q15124 567 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 MOXD2PA6NHM9 499 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 CPLX1O14810 134 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.639e-11■□□□□ 11.3
PTPRK-222ENST00000532751 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 EVI5O60447 810 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 IFNAR1P17181 557 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 CCND2P30279 289 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 BARHL2Q9NY43 387 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 PHF24Q9UPV7 400 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 MEIS2O14770 477 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SCG2P13521 617 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 STK3Q13188 491 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 NTRK3Q16288 839 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 GNASQ5JWF2 1037 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 STXBP3O00186 592 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 ZEB2O60315 1214 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 NEK4P51957 841 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 AK2P54819 239 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 NKX3-2P78367 333 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 KCNA10Q16322 511 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 PHKBQ93100 1093 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 FERMT2Q96AC1 680 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 MYADML2A6NDP7 307 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 SMCO2A6NFE2 343 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 ADCY7P51828 1080 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-222ENST00000532751 ACLYP53396 1101 aa25.21■■□□□ 1.63
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