RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR25O00155 361 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 LETM2Q2VYF4 491 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 FGD4Q96M96 766 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 PXMP2Q9NR77 195 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 WBP1LQ9NX94 342 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP4P98171 946 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 GRB14Q14449 540 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF174Q15697 407 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.93■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CLIC4Q9Y696 253 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 TDP2O95551 362 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 SREBF1P36956 1147 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 DPP9Q86TI2 863 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 USP28Q96RU2 1077 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 STRNO43815 780 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.743e-6■■■■■ 61.7
TSNARE1-208ENST00000524325 NEK8Q86SG6 692 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 MCM7P33993 719 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 PGM5Q15124 567 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 MORN1Q5T089 497 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRQQ9UN88 632 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 RPTORQ8N122 1335 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP2B6P20813 491 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 FCGRTP55899 365 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC38Q5R3I4 469 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 GJD2Q9UKL4 321 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.89■■□□□ 1.74
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.89■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.89■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.89■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM86B1E9PN63 330 aa25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 NR3C2P08235 984 aa25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 GJA10Q969M2 543 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC37A4O43826 429 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP2K5Q13163 448 aa25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF76P36508 570 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKCZQ05513 592 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 CCL14Q16627 93 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 MCTP2Q6DN12 878 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 CENPFP49454 3210 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FKTNO75072 461 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF22Q14807 665 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR16Q569H4 304 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 DNERQ8NFT8 737 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 USP6NLQ92738 828 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.86■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FIBPO43427 364 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGB5P18084 799 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO1Q5XXA6 986 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.85■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 FLT3LGP49771 235 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 USP11P51784 963 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 POTEDQ86YR6 584 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 MAML3Q96JK9 1138 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAPPC10P48553 1259 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP3A4P08684 503 aa25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms