RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517557.5

PTDSS1-203, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-203ENST00000517557 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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PTDSS1-203ENST00000517557 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PTDSS1-203ENST00000517557 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.58■■□□□ 1.85
PTDSS1-203ENST00000517557 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.58■■□□□ 1.85
PTDSS1-203ENST00000517557 CYP2C9P11712 490 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS1-203ENST00000517557 USP38Q8NB14 1042 aa26.57■■□□□ 1.84
PTDSS1-203ENST00000517557 COPS5Q92905 334 aa26.57■■□□□ 1.84
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PTDSS1-203ENST00000517557 ABCB11O95342 1321 aa26.57■■□□□ 1.84
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PTDSS1-203ENST00000517557 COL20A1Q9P218 1284 aa26.53■■□□□ 1.84
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PTDSS1-203ENST00000517557 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.49■■□□□ 1.83
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PTDSS1-203ENST00000517557 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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PTDSS1-203ENST00000517557 STXBP2Q15833 593 aa26.48■■□□□ 1.83
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PTDSS1-203ENST00000517557 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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PTDSS1-203ENST00000517557 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.48■■□□□ 1.83
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PTDSS1-203ENST00000517557 MYOGP15173 224 aa26.47■■□□□ 1.83
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PTDSS1-203ENST00000517557 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-203ENST00000517557 CHST3Q7LGC8 479 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-203ENST00000517557 AMNQ9BXJ7 453 aa26.45■■□□□ 1.82
PTDSS1-203ENST00000517557 OPLAHO14841 1288 aa26.44■■□□□ 1.82
PTDSS1-203ENST00000517557 CFBP00751 764 aa26.44■■□□□ 1.82
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