RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515964.1

RNU6-1129P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1129, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1129P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NTRK1P04629 796 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CCDC103Q8IW40 242 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ALG3Q92685 438 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DPF3Q92784 378 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MYO1BO43795 1136 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SCG5P05408 212 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PFKLP17858 780 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FPR2P25090 351 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LIMS1P48059 325 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KCNAB2Q13303 367 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IQCEQ6IPM2 695 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NETO2Q8NC67 525 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PEX11GQ96HA9 241 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CCDC140Q96MF4 163 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IER2Q9BTL4 223 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C22orf46C9J442 243 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LCP1P13796 627 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BCL6P41182 706 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARNTLO00327 626 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LTBRP36941 435 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MC3RP41968 323 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 USP53Q70EK8 1073 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CEP68Q76N32 757 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PRODHO43272 600 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ASGR2P07307 311 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PMLP29590 882 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 VMACQ2NL98 169 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NLRP10Q86W26 655 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FAM129CQ86XR2 697 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C1orf159Q96HA4 380 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TMEM169Q96HH4 297 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SGSM3Q96HU1 749 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PDPK1O15530 556 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DLX3O60479 287 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NCAM1P13591 858 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FBLN1P23142 703 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GTF2A2P52657 109 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MAP4K2Q12851 820 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SPATC1Q76KD6 591 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PWWP2AQ96N64 755 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.65□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZBTB7AO95365 584 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ATF2P15336 505 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SLC9A5Q14940 896 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MTERF2Q49AM1 385 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RNF38Q9H0F5 515 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CLDND1Q9NY35 253 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BLACEA4D250 179 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CAPNS1P04632 268 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms