RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 PEX11GQ96HA9 241 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB7AO95365 584 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 FUCA1P04066 466 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 NCAM1P13591 858 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 INF2Q27J81 1249 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 RNF38Q9H0F5 515 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ST7Q9NRC1 585 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 AGRPO00253 132 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 TESK1Q15569 626 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 DDR2Q16832 855 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ARNTLO00327 626 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ECI1P42126 302 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 CAP1Q01518 475 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.3□□□□□ -1.08
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PDE4D-221ENST00000514231 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 NTRK1P04629 796 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 GFRA1P56159 465 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ALG3Q92685 438 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 DIO2Q92813 273 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 PWWP2AQ96N64 755 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PQU0 124 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ASGR2P07307 311 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 ATF2P15336 505 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 KCNJ6P48051 423 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 GTF2A2P52657 109 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 FOXO4P98177 505 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 KCNAB2Q13303 367 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 RAB33AQ14088 237 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC103Q8IW40 242 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 SGSM3Q96HU1 749 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-221ENST00000514231 C22orf46C9J442 243 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 PPP2R2AP63151 447 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 BMP7P18075 431 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 LTBRP36941 435 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 CEP68Q76N32 757 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-221ENST00000514231 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.26□□□□□ -1.09
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PDE4D-221ENST00000514231 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 X6R8D5 127 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 MYO1BO43795 1136 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 PMLP29590 882 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 GRIA2P42262 883 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 LIMS1P48059 325 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 MAP4K2Q12851 820 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 MROH9Q5TGP6 573 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf159Q96HA4 380 aa8.25□□□□□ -1.09
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PDE4D-221ENST00000514231 INHBBP09529 407 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 BCL6P41182 706 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 SLC6A11P48066 632 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.24□□□□□ -1.09
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PDE4D-221ENST00000514231 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 C8orf37Q96NL8 207 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 SGSM2O43147 1006 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM13O60858 407 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-221ENST00000514231 ATP2B1P20020 1258 aa8.23□□□□□ -1.09
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