RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 PIGSQ96S52 555 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 RMDN3Q96TC7 470 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 MAF1Q9H063 256 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.49■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 OPLAHO14841 1288 aa22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 ARIH2O95376 493 aa22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 CD4P01730 458 aa22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 CPT1AP50416 773 aa22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.48■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 SLC27A2O14975 620 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.193e-7■□□□□ 8.4
CTBP1-211ENST00000511907 PRC1O43663 620 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 CYTH3O43739 400 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 TTLL4Q14679 1199 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 MFSD5Q6N075 450 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 CASC1Q6TDU7 716 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 MYL10Q9BUA6 226 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 LY9Q9HBG7 655 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.47■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 HSD17B4P51659 736 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 STXBP2Q15833 593 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 IWS1Q96ST2 819 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 PXMP2Q9NR77 195 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.46■■□□□ 1.19
CTBP1-211ENST00000511907 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 B4GALT4O60513 344 aa22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 COL6A3P12111 3177 aa22.45■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CSF2RAP15509 400 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CYP2C18P33260 490 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MCM5P33992 734 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 NECTIN1Q15223 517 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 LY6KQ17RY6 165 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 FAM161BQ96MY7 647 aa22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 NR3C2P08235 984 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 GHRHRQ02643 423 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.182e-7■■□□□ 11.7
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM199Q8N511 208 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 HIPK3Q9H422 1215 aa22.43■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC69A6NI79 296 aa22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 A6NJR5 290 aa22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 DDAH1O94760 285 aa22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 GH1P01241 217 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 ACRP10323 421 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 RXRAP19793 462 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CHMP4BP1P59074 171 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 TRAF1Q13077 416 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 AFG1LQ8WV93 481 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM87BQ96K49 555 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MTA3Q9BTC8 594 aa22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 POLR2MP0CAP2 368 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 KIF5BP33176 963 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CCL23P55773 120 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGAP1Q07960 439 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 IL31RAQ8NI17 732 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 MAP3K14Q99558 947 aa22.4■■□□□ 1.18
CTBP1-211ENST00000511907 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms