RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	CAP1	Q01518	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	GRB10	Q13322	594 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	CABP7	Q86V35	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	FUCA1	P04066	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	CELA3B	P08861	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	HTRA3	P83110	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	APBA2	Q99767	749 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ABCE1-208	ENST00000509593	NPHS1	O60500	1241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NTRK1	P04629	796 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	PLS3	P13797	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ETFB	P38117	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ARID5A	Q03989	594 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SCRN1	Q12765	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	BVES	Q8NE79	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	DPF3	Q92784	378 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	COPS5	Q92905	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	THBD	P07204	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	PLP2	Q04941	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	RTP5	Q14D33	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	INF2	Q27J81	1249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	MMP19	Q99542	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	RBL2	Q08999	1139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NCAPH	Q15003	741 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	CARF	Q8N187	725 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	USP40	Q9NVE5	1235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	C22orf46	C9J442	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ARNTL	O00327	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	SGSM2	O43147	1006 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	TBX1	O43435	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	NOBOX	O60393	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	C8B	P07358	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCE1-208	ENST00000509593	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms