RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 VHLLQ6RSH7 139 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-217ENST00000509355 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-217ENST00000509355 COPS5Q92905 334 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-217ENST00000509355 MTA3Q9BTC8 594 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-217ENST00000509355 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-217ENST00000509355 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-217ENST00000509355 ABCC2Q92887 1545 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 PTPRMP28827 1452 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 SASH1O94885 1247 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 HSPA2P54652 639 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 NCKAP1LP55160 1127 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 AMPD2Q01433 879 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PQJ5 194 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 CYP4F3Q08477 520 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 BICRALQ6AI39 1079 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ATF2P15336 505 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TACR1P25103 407 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 PRR5P85299 388 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.56□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 F8W031 263 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 SEPHS1P49903 392 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 NCAPHQ15003 741 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 BVESQ8NE79 360 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 AKT3Q9Y243 479 aa7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 C7orf72A4D263 438 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 PAMP19021 973 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 MBLAC2Q68D91 279 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 PWWP2AQ96N64 755 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 MMP19Q99542 508 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 APBA2Q99767 749 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 RNF38Q9H0F5 515 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.54□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 FFAR3O14843 346 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 HTRA3P83110 453 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 NFIXQ14938 502 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 VWA3BQ502W6 1294 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 LZTR1Q8N653 840 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 NETO2Q8NC67 525 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 DPF3Q92784 378 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.52□□□□□ -1.2
PDE4D-217ENST00000509355 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 ARNTLO00327 626 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 KCNH1O95259 989 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 CAPNS1P04632 268 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 ASGR2P07307 311 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 PFKLP17858 780 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 LIMS1P48059 325 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 FEZF2Q8TBJ5 459 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 CYP26B1Q9NR63 512 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 GULP1Q9UBP9 304 aa7.52□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 PLS3P13797 630 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 FOXO4P98177 505 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 SCRN1Q12765 414 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 FRS2Q8WU20 508 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 LGR4Q9BXB1 951 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-217ENST00000509355 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms