RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498724.5

TNC-208, Transcript of tenascin C, human

TSL 2

Gene TNC, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNC-208	ENST00000498724	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PSMA7	O14818	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PDE8A	O60658	829 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	HSF2BP	O75031	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TACC1	O75410	805 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PRDM1	O75626	825 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	DDAH1	O94760	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	IDE	P14735	1019 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	DPEP1	P16444	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	HSPA6	P17066	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	GPT	P24298	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	INPP5B	P32019	993 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	LIG3	P49916	1009 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	DNM2	P50570	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	IRAK1	P51617	712 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	NLRP5	P59047	1200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SPA17	Q15506	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PROX2	Q3B8N5	592 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	POTEM	A6NI47	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724		B4DLN1	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SRGN	P10124	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	FGFR2	P21802	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	CYP7A1	P22680	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MCM7	P33993	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PRCP	P42785	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	VAV2	P52735	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TGFB2	P61812	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	ZBED6	P86452	979 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	APBA1	Q02410	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	KCNB1	Q14721	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SEC23A	Q15436	765 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PKN1	Q16512	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MEA1	Q16626	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	POTEG	Q6S5H5	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TNC-208	ENST00000498724	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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