RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 MPP4Q96JB8 637 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SGCZQ96LD1 299 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 TEKT5Q96M29 485 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 RNF38Q9H0F5 515 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 RSAD1Q9HA92 442 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 FNIP2Q9P278 1114 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 PHF24Q9UPV7 400 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 INVSQ9Y283 1065 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 FHOD1Q9Y613 1164 aa5.97□□□□□ -1.45
STRADB-210ENST00000498648 KLHL33A6NCF5 533 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 AOC2O75106 756 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 OFD1O75665 1012 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 HRGP04196 525 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ADH7P40394 386 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CCT5P48643 541 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GPR85P60893 370 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SLC9A5Q14940 896 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DDB1Q16531 1140 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SKA1Q96BD8 255 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 VWCEQ96DN2 955 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GMCL1Q96IK5 515 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ZFP42Q96MM3 310 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DISC1Q9NRI5 854 aa5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LINC01387J3KSC0 135 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FSCN2O14926 492 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TMPRSS2O15393 492 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 BAG6P46379 1132 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RNF4P78317 190 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ID3Q02535 119 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PPP2R5DQ14738 602 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GRIK5Q16478 980 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 HYIQ5T013 277 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 BROXQ5VW32 411 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 EFHBQ8N7U6 833 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 RNF214Q8ND24 703 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PGBD4Q96DM1 585 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 MDFIQ99750 246 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 TGM5O43548 720 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 DDIT3P35638 169 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 GPR3P46089 330 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 SCAND1P57086 179 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 AMPD2Q01433 879 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PTSQ03393 145 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 IFFO2Q5TF58 517 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PPIL6Q8IXY8 311 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 CMIPQ8IY22 773 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FIBCD1Q8N539 461 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 KCT2Q8NC54 265 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 USP26Q9BXU7 913 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.94□□□□□ -1.46
STRADB-210ENST00000498648 OXSMQ9NWU1 459 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms