RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PXMP2	Q9NR77	195 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	NID2	Q14112	1375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	LRRC41	Q15345	812 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2S	Q16763	222 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MAF1	Q9H063	256 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	KBTBD13	C9JR72	458 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	STXBP3	O00186	592 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MEIS2	O14770	477 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	NR3C2	P08235	984 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SCG2	P13521	617 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	IFNAR1	P17181	557 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SMPD1	P17405	629 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	EDNRB	P24530	442 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	GHRHR	Q02643	423 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SCRN1	Q12765	414 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	STXBP2	Q15833	593 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	NTRK3	Q16288	839 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	IL31RA	Q8NI17	732 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	DPF3	Q92784	378 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	IWS1	Q96ST2	819 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SPC25	Q9HBM1	224 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MYADML2	A6NDP7	307 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SMCO2	A6NFE2	343 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PFKFB2	O60825	505 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	LARGE1	O95461	756 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	CAPN2	P17655	700 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ADCY7	P51828	1080 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	BEX3	Q00994	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PGM5	Q15124	567 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PKN1	Q16512	942 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ME3	Q16798	604 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	RNF180	Q86T96	592 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	COPS5	Q92905	334 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	KIF2C	Q99661	725 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	BARHL2	Q9NY43	387 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	DNM1L	O00429	736 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SORBS3	O60504	671 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ADAMTS4	O75173	837 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	CCND2	P30279	289 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	KCNA10	Q16322	511 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	TLK2	Q86UE8	772 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CALD1-223	ENST00000496024	PGBD1	Q96JS3	809 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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