RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 TBC1D5Q92609 795 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CNKSR1Q969H4 720 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 IL21Q9HBE4 155 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 INTS13Q9NVM9 706 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ADAMTS12P58397 1594 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SBNO1A3KN83 1393 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RIMS2Q9UQ26 1411 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ABCC6O95255 1503 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 LMTK2Q8IWU2 1503 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 LRRD1A4D1F6 860 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GMNCA6NCL1 334 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CFAP73A6NFT4 308 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 E7EVH7 732 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 PSMD14O00487 310 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 KIF3BO15066 747 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ECEL1O95672 775 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CTSHP09668 335 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CMA1P23946 247 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 EPHB4P54760 987 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 NR1I3Q14994 352 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SLC4A10Q6U841 1118 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CNGA4Q8IV77 575 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CD302Q8IX05 232 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ATL2Q8NHH9 583 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CAVIN3Q969G5 261 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ARL8AQ96BM9 186 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 TRIM4Q9C037 500 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 MAF1Q9H063 256 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF358Q9NW07 568 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 DACH1Q9UI36 760 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 USP3Q9Y6I4 520 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 NEDD4P46934 1319 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 UBN2Q6ZU65 1347 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.06□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RNF223E7ERA6 249 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CHL1O00533 1208 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 FYB1O15117 783 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SPTLC2O15270 562 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 PPIP5K2O43314 1243 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 KIF4AO95239 1232 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 NPTXRO95502 500 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 MYL1P05976 194 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GSTA1P08263 222 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 VIMP08670 466 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 NR1D1P20393 614 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CCND1P24385 295 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 WEE1P30291 646 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ALDH3A1P30838 453 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SCNN1DP51172 638 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RHBDL3P58872 404 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GUCY1A3Q02108 690 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SERINC3Q13530 473 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 GNPTABQ3T906 1256 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 FAM26DQ5JW98 314 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ODR4Q5SWX8 454 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 NUTM2GQ5VZR2 741 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 RINLQ6ZS11 566 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 Q6ZUG5 572 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CCDC63Q8NA47 563 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 CAGE1Q8TC20 777 aa4.05□□□□□ -1.76
FUBP1-211ENST00000489495 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms