RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 MARCH6O60337 910 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 MUM1L1Q5H9M0 696 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 KANK3Q6NY19 840 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC34Q96HJ3 373 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 MBOAT7Q96N66 472 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 RBSNQ9H1K0 784 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 LOC285556D6RIA3 1793 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 ATP2A1O14983 1001 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CYP3A4P08684 503 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 UBA7P41226 1012 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 TECP42680 631 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 GHRHRQ02643 423 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 DHX58Q96C10 678 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA1468Q9P260 1216 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 USP25Q9UHP3 1055 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 SERTAD1Q9UHV2 236 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 A0A087X0B3 334 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM132BQ14DG7 1078 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 TEX13BQ9BXU2 312 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 RAB34Q9BZG1 259 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CIITAP33076 1130 aa30.3■■■□□ 2.44
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HOXB3-210ENST00000489475 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 RNF146Q9NTX7 359 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CDC25AP30304 524 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 IQUBQ8NA54 791 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 SLFN14P0C7P3 912 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 SNAPC2Q13487 334 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 Q4G0T1 1027 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 PRR16Q569H4 304 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 IGSF22Q8N9C0 903 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CCSER1Q9C0I3 900 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 RIPK3Q9Y572 518 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 PP2D1A8MPX8 630 aa30.28■■■□□ 2.44
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HOXB3-210ENST00000489475 MB21D1Q8N884 522 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 RASSF8Q8NHQ8 419 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 HAS1Q92839 578 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
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HOXB3-210ENST00000489475 PLS1Q14651 629 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 TKFCQ3LXA3 575 aa30.27■■■□□ 2.44
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HOXB3-210ENST00000489475 FAM86B1E9PN63 330 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 FAM86B2P0C5J1 330 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 STAT3P40763 770 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC39Q9UFE4 941 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 PCDHA12Q9UN75 941 aa30.26■■■□□ 2.44
HOXB3-210ENST00000489475 TBX3O15119 743 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 GJA5P36382 358 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 RPS6P62753 249 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 PNOCQ13519 176 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 RNF207Q6ZRF8 634 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
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HOXB3-210ENST00000489475 KARSQ15046 597 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
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HOXB3-210ENST00000489475 STX1AQ16623 288 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 NSMFQ6X4W1 530 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 LBX2Q6XYB7 198 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 CABP7Q86V35 215 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 COL20A1Q9P218 1284 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 UBXN2AP68543 259 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 MOGSQ13724 837 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 E2F4Q16254 413 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 LENG9Q96B70 501 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 DISC1Q9NRI5 854 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.438e-6■■□□□ 12.6
HOXB3-210ENST00000489475 STAT6P42226 847 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 ANO6Q4KMQ2 910 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 RRAGBQ5VZM2 374 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 CHADLQ6NUI6 762 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 ANO10Q9NW15 660 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 RPTORQ8N122 1335 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 FAM20AQ96MK3 541 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-210ENST00000489475 ACAD9Q9H845 621 aa30.23■■■□□ 2.43
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