RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 RARBP10826 455 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SMPD1P17405 629 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PDE4DQ08499 809 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 LRRC41Q15345 812 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 UBE2SQ16763 222 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa13.99□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ADAMTS4O75173 837 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 TNFAIP2Q03169 654 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SCRN1Q12765 414 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 TRAF1Q13077 416 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PPP2R5BQ15173 497 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 NECAB1Q8N987 351 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PDCD2LQ9BRP1 358 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 MAF1Q9H063 256 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 VTA1Q9NP79 307 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa13.98□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 CTAGE5O15320 804 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ARIH2O95376 493 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 NR3C2P08235 984 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 COL6A1P12109 1028 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 IFNAR1P17181 557 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 NAPAP54920 295 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PGM5Q15124 567 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ME3Q16798 604 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 COPS5Q92905 334 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 FERMT2Q96AC1 680 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PSTPIP2Q9H939 334 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.97□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PIK3CDO00329 1044 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 DNM1LO00429 736 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PFKFB2O60825 505 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 RGS20O76081 388 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 CTDNEP1O95476 244 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SCG2P13521 617 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 BEX3Q00994 111 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SAMD3Q8N6K7 520 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 PGBD1Q96JS3 809 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 AIFM3Q96NN9 605 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 IWS1Q96ST2 819 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 WDR11Q9BZH6 1224 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 TMEM260Q9NX78 707 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 BARHL2Q9NY43 387 aa13.96□□□□□ -0.17
NISCH-210ENST00000488157 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 SMCO2A6NFE2 343 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 GJA9P57773 515 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 ST3GAL1Q11201 340 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 STXBP2Q15833 593 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 TLK2Q86UE8 772 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 VSIG10LQ86VR7 867 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 CUL5Q93034 780 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 FRMPD4Q14CM0 1322 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 KBTBD13C9JR72 458 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 CAPN2P17655 700 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD1Q15327 319 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 KCNA10Q16322 511 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 LY6KQ17RY6 165 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 CCDC62Q6P9F0 684 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 RNF180Q86T96 592 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 DPF3Q92784 378 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-210ENST00000488157 RIC8AQ9NPQ8 531 aa13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms