RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 INF2Q27J81 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 ZNF605Q86T29 641 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 CCDC103Q8IW40 242 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FAM84AQ96KN4 292 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MTA3Q9BTC8 594 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 GPR27Q9NS67 375 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 C2orf27AQ580R0 203 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 OGFOD2Q6N063 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 JMYQ8N9B5 988 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SLC38A3Q99624 504 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 BTG4Q9NY30 223 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.68□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 NUDT19A8MXV4 375 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FUCA1P04066 466 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 DBHP09172 617 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SDHBP21912 280 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 LSAMPQ13449 338 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 NETO2Q8NC67 525 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 DPF3Q92784 378 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.67□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 ARNTLO00327 626 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SEMA7AO75326 666 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 GLI4P10075 376 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 BCL6P41182 706 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MAPKAPK2P49137 400 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FAM209AQ5JX71 171 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MROH9Q5TGP6 573 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 STYK1Q6J9G0 422 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 RPTNQ6XPR3 784 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PEX11GQ96HA9 241 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TMEM169Q96HH4 297 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 C22orf46C9J442 243 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 H7BY64 318 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 MESP2Q0VG99 397 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 NTRK3Q16288 839 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PKN1Q16512 942 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 CEP68Q76N32 757 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 Q8N1Y9 231 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 LILRB2Q8N423 598 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PTPRN2Q92932 1015 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 EXOC2Q96KP1 924 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PIF1Q9H611 641 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.65□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 F8W031 263 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 AQP7O14520 342 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 APPP05067 770 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 LCP1P13796 627 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 NAT1P18440 290 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 VIPR1P32241 457 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 GPR85P60893 370 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 GABREP78334 506 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 KIZQ2M2Z5 673 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 LCE4AQ5TA78 99 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 CLDND1Q9NY35 253 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 X6R8D5 127 aa6.64□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.63□□□□□ -1.35
PTEN-204ENST00000487939 BLACEA4D250 179 aa6.63□□□□□ -1.35
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