RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487280.1

WDPCP-215, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 4

Gene WDPCP, Length 524 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-215ENST00000487280 FOXO4P98177 505 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 MVKQ03426 396 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 RTP2Q5QGT7 225 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 FERMT3Q86UX7 667 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 FGD4Q96M96 766 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SPATA25Q9BR10 227 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.38□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SH3D21A4FU49 640 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 B2RBV5 119 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 DDAH1O94760 285 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 DBHP09172 617 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 HTRA3P83110 453 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SOGA3Q5TF21 947 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 BVESQ8NE79 360 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 RNF38Q9H0F5 515 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.37□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 A0A1B0GTL3 188 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 TNFRSF1AP19438 455 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ADAM17P78536 824 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ZXDAP98168 799 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SERINC3Q13530 473 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.36□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 AURKAO14965 403 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ATF2P15336 505 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 AMPD2Q01433 879 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 JAMLQ86YT9 394 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 NAT16Q8N8M0 369 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 AKT3Q9Y243 479 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.35□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 A0A1W2PQJ5 194 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 CAPNS1P04632 268 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 PPP2R5DQ14738 602 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.34□□□□□ -1.39
WDPCP-215ENST00000487280 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 SUV39H1O43463 412 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 NOBOXO60393 691 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 ITGB3P05106 788 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 CD3EP07766 207 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 GSTM1P09488 218 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 NCAM1P13591 858 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 CNR2P34972 360 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 BICRALQ6AI39 1079 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 MKL1Q969V6 931 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 SGSM3Q96HU1 749 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 DRC1Q96MC2 740 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 LNPKQ9C0E8 428 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.33□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 MATN3O15232 486 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 ITGAVP06756 1048 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 IFNGR1P15260 489 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 CORO7P57737 925 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 GJA9P57773 515 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 RASGRF1Q13972 1273 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 CARFQ8N187 725 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 COPS5Q92905 334 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.32□□□□□ -1.4
WDPCP-215ENST00000487280 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms