RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	CD248	Q9HCU0	757 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	GINM1	Q9NU53	330 aa		5	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	FZD7	O75084	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	ACR	P10323	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	L1CAM	P32004	1257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		4.99	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	THBS2	P35442	1172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	ICAM4	Q14773	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	LGI4	Q8N135	537 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	SPATA32	Q96LK8	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	C8B	P07358	591 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	IFNGR1	P15260	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	NKD1	Q969G9	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM208A-208	ENST00000487036	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	AMH	P03971	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	KLF10	Q13118	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	BRF1	Q92994	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	VPS11	Q9H270	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	GPR42	O15529	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	B4GALT3	O60512	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	CD247	P20963	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SHD	Q96IW2	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	RBL2	Q08999	1139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	FIBCD1	Q8N539	461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	KY	Q8NBH2	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF536	O15090	1300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	CYP2C8	P10632	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ETFB	P38117	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF165	P49910	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM208A-208	ENST00000487036		A0A087WZG4	1122 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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