RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.73□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 C8BP07358 591 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 RNF34Q969K3 372 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 SLC9A7Q96T83 725 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 FHOD1Q9Y613 1164 aa5.72□□□□□ -1.49
PHC3-211ENST00000486042 B4GALT3O60512 393 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF76P36508 570 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF445P59923 1031 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 FANCCQ00597 558 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 POU4F1Q01851 419 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CLCQ05315 142 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PRR31Q5SQ13 230 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 WDR26Q9H7D7 661 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 COPRSQ9NQ92 184 aa5.71□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 C9IYK1 514 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 GPR42O15529 346 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ACRP10323 421 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 GK5Q6ZS86 529 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF575Q86XF7 245 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 NT5DC4Q86YG4 428 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 GP6Q9HCN6 339 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.7□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 IFNGR1P15260 489 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 TGM1P22735 817 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 SELENOPP49908 381 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF165P49910 485 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PALM2Q8IXS6 379 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 FIBCD1Q8N539 461 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 BRF1Q92994 677 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 MTA3Q9BTC8 594 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.69□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 A0A087WZG4 1122 aa5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 MUSKO15146 869 aa5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CD3EP07766 207 aa5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CRKP46108 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 FHL2Q14192 279 aa5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 WWC2Q6AWC2 1192 aa5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PATE3B3GLJ2 98 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CD247P20963 164 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 EPHB4P54760 987 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 INHBEP58166 350 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PPP2CBP62714 309 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PPP2CAP67775 309 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 SEZ6Q53EL9 994 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 C8orf37Q96NL8 207 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 MCM4P33991 863 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ITGA1P56199 1179 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 DCAF15Q66K64 600 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 MIB1Q86YT6 1006 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 USP33Q8TEY7 942 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 GGT7Q9UJ14 662 aa5.66□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF623O75123 536 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ITGA4P13612 1032 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 SYT3Q9BQG1 590 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.65□□□□□ -1.5
PHC3-211ENST00000486042 AURKAO14965 403 aa5.64□□□□□ -1.51
PHC3-211ENST00000486042 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PHC3-211ENST00000486042 ZNF394Q53GI3 561 aa5.64□□□□□ -1.51
PHC3-211ENST00000486042 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.64□□□□□ -1.51
PHC3-211ENST00000486042 SLFN13Q68D06 897 aa5.64□□□□□ -1.51
PHC3-211ENST00000486042 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.64□□□□□ -1.51
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