RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CCSAP-204ENST00000483092 RCCD1A6NED2 376 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SARSP49591 514 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 KLK7P49862 253 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 HERVK_113P62684 666 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA4Q8NEY3 305 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MIEF2Q96C03 454 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 GRIN2DO15399 1336 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM170AA1A519 330 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CUL4BQ13620 913 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MS4A14Q96JA4 679 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 C4AP0C0L4 1744 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 C4BP0C0L5 1744 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 HGSO14964 777 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CDC25CP30307 473 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 NLRP14Q86W24 1093 aa17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD14O00487 310 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 RFC4P35249 363 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MSL1Q68DK7 614 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CALRP27797 417 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 EPHB4P54760 987 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R7Q15435 360 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 C2CD5Q86YS7 1000 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.94■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CLTAP09496 248 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CARSP49589 748 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TCP11Q8WWU5 503 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R37O75864 691 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TMTC3Q6ZXV5 915 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 STIM2Q9P246 746 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 F8W031 263 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ARID5AQ03989 594 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM14Q14142 442 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 OR2W6PQ8NHA6 318 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ALS2CR12Q96Q35 445 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PHF20Q9BVI0 1012 aa17.93■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PP2D1A8MPX8 630 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO33Q7Z6M2 555 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PARP9Q8IXQ6 854 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 GSDMAQ96QA5 445 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TMOD1P28289 359 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 UIMC1Q96RL1 719 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TANGO6Q9C0B7 1094 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 EPN3Q9H201 632 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM23A6NLE4 172 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM153BP0C7A2 387 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM153CQ494X1 144 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 BRIP1Q9BX63 1249 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM153AQ9UHL3 310 aa17.92■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 OPLAHO14841 1288 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 RAD21O60216 631 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TSPY3P0CV98 308 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TSPY8P0CW00 308 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 SCG2P13521 617 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PRCPP42785 496 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FUT2Q10981 343 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC178Q5BJE1 867 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MB21D1Q8N884 522 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 KRT12Q99456 494 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PBX1P40424 430 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 STAT6P42226 847 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 EIF6P56537 245 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 IFT20Q8IY31 132 aa17.91■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PNMA1Q8ND90 353 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms