RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481995.5

HOXB-AS3-211, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 523 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TLK2Q86UE8 772 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DGKHQ86XP1 1220 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HLA-CQ95604 372 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KIFC2Q96AC6 838 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SCLYQ96I15 445 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TMEM87BQ96K49 555 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TNKSO95271 1327 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PRC1O43663 620 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 B4GALT4O60513 344 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NMT2O60551 498 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PFKMP08237 780 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ACTN1P12814 892 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LIFRP42702 1097 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 EVCP57679 992 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IQCA1Q86XH1 822 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 LY9Q9HBG7 655 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 HOMER2Q9NSB8 354 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NID2Q14112 1375 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GPR37L1O60883 481 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TTLL1O95922 423 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CPA1P15085 419 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CHST13Q8NET6 341 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TOMM22Q9NS69 142 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KIF28PB7ZC32 967 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ATP2A1O14983 1001 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CTAGE5O15320 804 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TLL1O43897 1013 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PSMC6P62333 389 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RABEP1Q15276 862 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.45■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ASB14A6NK59 587 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 F5H6K3 240 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SNHG28P0DPA3 235 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KLRC3Q07444 240 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TTLL4Q14679 1199 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 KRT40Q6A162 431 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CHST3Q7LGC8 479 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLC9A7Q96T83 725 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SENP2Q9HC62 589 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NDUFB10O96000 172 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NKX3-2P78367 333 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CNTN2Q02246 1040 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FGD4Q96M96 766 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 UIMC1Q96RL1 719 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ACAD9Q9H845 621 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 FEM1BQ9UK73 627 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SCN5AQ14524 2016 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ASTN1O14525 1302 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 EPOPA6NHQ4 379 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 RCAN1P53805 252 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 OAZ1P54368 228 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TROAPQ12815 778 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 WTAPQ15007 396 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 Q6ZUG5 572 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TMTC2Q8N394 836 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms