RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, human

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKIL-208	ENST00000477216	SMARCA1	P28370	1054 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	MTMR8	Q96EF0	704 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	SPC25	Q9HBM1	224 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	TTC28	Q96AY4	2481 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	CDC27	P30260	824 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ACLY	P53396	1101 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	PNMA2	Q9UL42	364 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ELP1	O95163	1332 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ALAS1	P13196	640 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	GRIN2C	Q14957	1233 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	TKFC	Q3LXA3	575 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	HOMER1	Q86YM7	354 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	PIGS	Q96S52	555 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		28.9	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ZBTB5	O15062	677 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ITGB8	P26012	769 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	FAAP100	Q0VG06	881 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	MFSD5	Q6N075	450 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	TMEM199	Q8N511	208 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	CDH23	Q9H251	3354 aa		28.89	■■■□□ 2.22
SKIL-208	ENST00000477216	ADAMTS4	O75173	837 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PGK2	P07205	417 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	CHST13	Q8NET6	341 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	RNF146	Q9NTX7	359 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	EPHB4	P54760	987 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	FUT2	Q10981	343 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	STK3	Q13188	491 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	USH1G	Q495M9	461 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	FBXO11	Q86XK2	927 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	DDX11	Q96FC9	970 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	FBXO40	Q9UH90	709 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		28.87	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	IL27	Q8NEV9	243 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	ACAD9	Q9H845	621 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	AMN	Q9BXJ7	453 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	RAB30	Q15771	203 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	KCNA10	Q16322	511 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	MSRA	Q9UJ68	235 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	TBX21	Q9UL17	535 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	ST18	O60284	1047 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	PFKFB2	O60825	505 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	THEG	Q9P2T0	379 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216	ABCB11	O95342	1321 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SKIL-208	ENST00000477216		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	LARGE1	O95461	756 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	SCRN1	Q12765	414 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	TRAF1	Q13077	416 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	NTRK3	Q16288	839 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	ME3	Q16798	604 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SKIL-208	ENST00000477216	NFIB	O00712	420 aa		28.81	■■■□□ 2.2

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