RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 PP2D1A8MPX8 630 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 RIMBP2O15034 1052 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLC37A4O43826 429 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TBC1D12O60347 775 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TPM1P09493 284 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 NUBP1P53384 320 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 RBL2Q08999 1139 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 PICALMQ13492 652 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLC15A2Q16348 729 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 RAD9BQ6WBX8 426 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 HOMER1Q86YM7 354 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MB21D1Q8N884 522 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 KIAA0895Q8NCT3 520 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 RAD54LQ92698 747 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 NT5C3AQ9H0P0 336 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CPVLQ9H3G5 476 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MEIS2O14770 477 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 N4BP3O15049 544 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TADA3O75528 432 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TDP2O95551 362 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MUTP22033 750 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CDC25AP30304 524 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CASP14P31944 242 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SREBF1P36956 1147 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 STX17P56962 302 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 PDE4DQ08499 809 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 STK4Q13043 487 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 DOK7Q18PE1 504 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 KRT79Q5XKE5 535 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLFN13Q68D06 897 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SV2BQ7L1I2 683 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 FAM83AQ86UY5 434 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 STAMQ92783 540 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 COA7Q96BR5 231 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 AMNQ9BXJ7 453 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 GINM1Q9NU53 330 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 EXOC1Q9NV70 894 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TMEM260Q9NX78 707 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 COL4A5P29400 1685 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MYMKA6NI61 221 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 YDJCA8MPS7 323 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 USP17L10C9JJH3 530 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 F5H6K3 240 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ATP8B1O43520 1251 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 LCA5LO95447 670 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ARHGAP25P42331 645 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TECP42680 631 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLC1A4P43007 532 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SCNN1DP51172 638 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ERVK-24P63145 666 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ICA1Q05084 483 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 KLRC3Q07444 240 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MIIPQ5JXC2 388 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 OR8K1Q8NGG5 319 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-207ENST00000475060 FAM151AQ8WW52 585 aa7.28□□□□□ -1.24
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