RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 HLA-CQ95604 372 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS3-211ENST00000474346 NMT2O60551 498 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 PTGS1P23219 599 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 NT5C2P49902 561 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TTC14Q96N46 770 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 SCN5AQ14524 2016 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 EFCAB14O75071 495 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TXNP10599 105 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 MX1P20591 662 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CALML3P27482 149 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 SLC16A2P36021 539 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 KCNQ1P51787 676 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RPS6P62753 249 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 SESTD1Q86VW0 696 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 MTMR7Q9Y216 660 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TLL1O43897 1013 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 SLC30A10Q6XR72 485 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TOMM22Q9NS69 142 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 ZMYM6O95789 1325 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RFXAPO00287 272 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 FOXP2O15409 715 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 PDHBP11177 359 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RBL2Q08999 1139 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 PTGISQ16647 500 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 EVI5LQ96CN4 794 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CERS4Q9HA82 394 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 REV3LO60673 3130 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 SNHG28P0DPA3 235 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 SELPP16109 830 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 ZNF543Q08ER8 600 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 GRB10Q13322 594 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 IWS1Q96ST2 819 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 INCENPQ9NQS7 918 aa15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 EPOPA6NHQ4 379 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 GPR37L1O60883 481 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 GH1P01241 217 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RAD9AQ99638 391 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TNS3-211ENST00000474346 LPXNO60711 386 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 FGAP02671 866 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 CXCL10P02778 98 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 STXBP2Q15833 593 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 DGKDQ16760 1214 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 COPS5Q92905 334 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 ABCB11O95342 1321 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 GJB5O95377 273 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 MMP3P08254 477 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 IKBKEQ14164 716 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 VPS53Q5VIR6 699 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 DGKHQ86XP1 1220 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 AFG1LQ8WV93 481 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 ERVK-21P61565 698 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 ARHGAP1Q07960 439 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 PTK7Q13308 1070 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 KRT40Q6A162 431 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS3-211ENST00000474346 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms