RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473460.1

GINS1-202, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GINS1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-202ENST00000473460 PAMP19021 973 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 TNFRSF1AP19438 455 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 SOX9P48436 509 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 GIPRP48546 466 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 AMPD2Q01433 879 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 SLC7A5Q01650 507 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 PAK2Q13177 524 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 GRB10Q13322 594 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 PPM1BO75688 479 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 DPF3Q92784 378 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 COPS5Q92905 334 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 PALD1Q9ULE6 856 aa5.84□□□□□ -1.47
GINS1-202ENST00000473460 MATN3O15232 486 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 FUCA1P04066 466 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CYP2C8P10632 490 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 THBS2P35442 1172 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CRBNQ96SW2 442 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.83□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SGSM2O43147 1006 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 NPHS1O60500 1241 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 RECKO95980 971 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 PLATP00750 562 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 MIB1Q86YT6 1006 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 USP33Q8TEY7 942 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 MMP19Q99542 508 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CLEC1BQ9P126 229 aa5.82□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 PLS3P13797 630 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CYP4F3Q08477 520 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SCRN1Q12765 414 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 INF2Q27J81 1249 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 RGL3Q3MIN7 710 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 PRR31Q5SQ13 230 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SHDQ96IW2 340 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.81□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 ZNF20P17024 532 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CPZQ66K79 652 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 STK32CQ86UX6 486 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 KYQ8NBH2 561 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 C8orf49Q96NF6 230 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SAMD11Q96NU1 681 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 AKT3Q9Y243 479 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 INVSQ9Y283 1065 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 EMC9Q9Y3B6 208 aa5.8□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 KCNH1O95259 989 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 THBDP07204 575 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CASP7P55210 303 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 ITGA1P56199 1179 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 ZXDAP98168 799 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 SPATA32Q96LK8 384 aa5.79□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 PPP2R5EQ16537 467 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 MCTP2Q6DN12 878 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 VHLLQ6RSH7 139 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 CD300LDQ6UXZ3 194 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 GPRASP2Q96D09 838 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 LOXL4Q96JB6 756 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 LGR4Q9BXB1 951 aa5.78□□□□□ -1.48
GINS1-202ENST00000473460 MROH6A6NGR9 719 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 C22orf46C9J442 243 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 ARNTLO00327 626 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 FPR2P25090 351 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 SLC6A11P48066 632 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 GJA8P48165 433 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 CR1LQ2VPA4 569 aa5.77□□□□□ -1.49
GINS1-202ENST00000473460 LGI4Q8N135 537 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms