RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 CALM2P0DP24 149 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 CALM3P0DP25 149 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCA1P28370 1054 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP2R5BQ15173 497 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 RMDN3Q96TC7 470 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYL10Q9BUA6 226 aa21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.86■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KIAA0355O15063 1070 aa21.84■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 SZT2Q5T011 3432 aa21.83■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CDK7P50613 346 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAAP100Q0VG06 881 aa21.83■■□□□ 1.09
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TRAPPC10-208ENST00000469521 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.81■■□□□ 1.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TXNP10599 105 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HSPA4P34932 840 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.79■■□□□ 1.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 COPS5Q92905 334 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CD4P01730 458 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIK3CDO00329 1044 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 TIMP1P01033 207 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 GH1P01241 217 aa21.76■■□□□ 1.07
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