RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 USP33Q8TEY7 942 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PEX11GQ96HA9 241 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FFAR3O14843 346 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PLS3P13797 630 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 NFIXQ14938 502 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 VPS37DQ86XT2 251 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SYT8Q8NBV8 401 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 LGR4Q9BXB1 951 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PMLP29590 882 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 MBLAC2Q68D91 279 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 MMP19Q99542 508 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 THBDP07204 575 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC9A5Q14940 896 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 VWA3BQ502W6 1294 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 TNNI3KQ59H18 835 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 DRC1Q96MC2 740 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FUCA1P04066 466 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 TCF3P15923 654 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 B2RBV5 119 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB7AO95365 584 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 NTRK1P04629 796 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SYN1P17600 705 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 HTRA3P83110 453 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SLURP1P55000 103 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNC1P48547 511 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP4F3Q08477 520 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 INF2Q27J81 1249 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SV2CQ496J9 727 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 CXorf38Q8TB03 319 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 FRS2Q8WU20 508 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 DPF3Q92784 378 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.325e-30■□□□□ 9.5
RABGGTB-204ENST00000461653 BTG4Q9NY30 223 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GTL3 188 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 TBX1O43435 398 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 SUSD5O60279 629 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 ETFBP38117 255 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 LIPIQ6XZB0 460 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 DDAH1O94760 285 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGAVP06756 1048 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3D21A4FU49 640 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 FXNQ16595 210 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 IQCEQ6IPM2 695 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 TEPSINQ96N21 525 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 C22orf46C9J442 243 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 FGRP09769 529 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXC12P31275 282 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-204ENST00000461653 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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