RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.85□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 B2RBV5 119 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 FUCA1P04066 466 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 THBDP07204 575 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 CAP1Q01518 475 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 MMP19Q99542 508 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 SIT1Q9Y3P8 196 aa5.84□□□□□ -1.47
TTC3-211ENST00000460328 A0A1B0GTL3 188 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 NTRK1P04629 796 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 HTRA3P83110 453 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CYP4F3Q08477 520 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 VPS37DQ86XT2 251 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 BTN2A2Q8WVV5 523 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 BTG4Q9NY30 223 aa5.83□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TBX1O43435 398 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SYN1P17600 705 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 KCNC1P48547 511 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SLURP1P55000 103 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SLC9A5Q14940 896 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 INF2Q27J81 1249 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SV2CQ496J9 727 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TNNI3KQ59H18 835 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TEX2Q8IWB9 1127 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 FRS2Q8WU20 508 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 DPF3Q92784 378 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.82□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SUSD5O60279 629 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 DDAH1O94760 285 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ZBTB7AO95365 584 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ITGAVP06756 1048 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TCF3P15923 654 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ETFBP38117 255 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 LIPIQ6XZB0 460 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SPATA25Q9BR10 227 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.81□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 FPR2P25090 351 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CXorf38Q8TB03 319 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 NOX5Q96PH1 765 aa5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SH3D21A4FU49 640 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 C22orf46C9J442 243 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ECI1P42126 302 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CCDC103Q8IW40 242 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 DIO2Q92813 273 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ZNF428Q96B54 188 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 DDX11Q96FC9 970 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TEPSINQ96N21 525 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ARNTLO00327 626 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SGSM2O43147 1006 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 C8BP07358 591 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 FGRP09769 529 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 HOXC12P31275 282 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 FXNQ16595 210 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 FRMD5Q7Z6J6 570 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 SYT3Q9BQG1 590 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TINF2Q9BSI4 451 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 JAG2Q9Y219 1238 aa5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
TTC3-211ENST00000460328 GJB6O95452 261 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC3-211ENST00000460328 SCG5P05408 212 aa5.77□□□□□ -1.49
TTC3-211ENST00000460328 CYP2C8P10632 490 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms