RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 REC8O95072 547 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 BEX3Q00994 111 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 STXBP2Q15833 593 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 ARHGEF16Q5VV41 709 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 TOX2Q96NM4 488 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 OPLAHO14841 1288 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 FANCBQ8NB91 859 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 DCDC2CA8MYV0 355 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 POLR2MP0CAP2 368 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PPP2R5BQ15173 497 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM63BQ5T3F8 832 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 KCNB2Q92953 911 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 LRRC37A2A6NM11 1700 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 CLTBP09497 229 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 HSPA4P34932 840 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 TTLL4Q14679 1199 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PXMP2Q9NR77 195 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 SLC34A2O95436 690 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 RXRAP19793 462 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 CPT1AP50416 773 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 ARVCFO00192 962 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 NR3C2P08235 984 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 CDK7P50613 346 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPN4-208ENST00000460289 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 PTGS1P23219 599 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 FGD1P98174 961 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 APOA5Q6Q788 366 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 MICU3Q86XE3 530 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM39AQ9NV64 488 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM43BA6NCK2 446 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TDHQ8IZJ6 230 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 KIAA0355O15063 1070 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 ZBTB43O43298 467 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 FAAP100Q0VG06 881 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 KPNA6O60684 536 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 PSMA5P28066 241 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 ITGA7Q13683 1181 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.54■■□□□ 1.84
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PTPN4-208ENST00000460289 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 A6NJR5 290 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 ARIH2O95376 493 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 RAG1P15918 1043 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 PGM5Q15124 567 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 COPS5Q92905 334 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 BADQ92934 168 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 GH1P01241 217 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 RCAN1P53805 252 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 RTN1Q16799 776 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 LY6KQ17RY6 165 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 KCNV1Q6PIU1 500 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPN4-208ENST00000460289 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.52■■□□□ 1.84
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